Présentation de l'UE NeuroImagerie (M2 neurosciences)
Organisation : J Foucher
Avec : L Harsan, V Noblet, L Landré, F Blanc, IJ Namer, C Po
Voir le teaser (15 min) : Intérêt de l'étude de la neuroimagerie en neurosciences, objectifs, méthode, sommaire et informations diverses sur cette UE.
Pour les internautes disposant d'un login, il est possible d'accéder aux :
- Cours niveau "initiation" : cours magistraux (e-learning), questionnaires, planning des TD/TP, évaluation de l'UE
- Cours niveau "avancé" : Cours magistraux (e-learning), questionnaires, planning des TD/TP, évaluation de l'UE
- Cours facultatifs, documents complémentaires, annales
- Sujets de master/thèse proposés
Introduction
Nous appellerons "imagerie cérébrale", toutes les techniques d'exploration anatomique et/ou fonctionnelle de tout ou d'une large portion de l'encéphale qui soient non invasives et donc applicables à l'homme mais aussi à l'animal. Les moyens d'investigation sont divers : tomodensitométrie (scanner X), tomographie par émission de positons (PET) ou de simple photons (SPECT), imagerie par résonance magnétique (IRM – anatomique, fonctionnelle, de diffusion, de perfusion, transfert de magnétisation, spectroscopie, angiographie…), électro-encéphalographie (EEG) ou magnéto-encéphalographie (MEG), imagerie spectroscopique dans le proche infrarouge (NIRS), mais aussi la stimulation magnétique trans-crânienne (TMS). Chacune de ces techniques s'accompagne de modalités d'analyse spécifiques en fonction de l'objectif visé (approche localisatrice – notion de cartographie et d'atlas –, en connectivité anatomique et/ou fonctionnelle et/ou effective, en réseau, intégrative). L’objectif de cette formation est d’apporter aux étudiants les principes théoriques et pratiques sur l'instrumentation et l'analyse, ainsi que l'anatomie et la physiologie cérébrale et les bases de neuropsychologie.
A la fin de la formation l'étudiant devra pouvoir comprendre un article de neuroimagerie, avoir les bases nécessaires pour reproduire l'expérience qu'il décrit, mais aussi le critiquer quant à la méthodologie, l'analyse et les résultats. Le large panel de techniques d'acquisition et d'analyse qui lui seront exposées sous la forme d'une analyse en terme d'avantage / inconvénient, lui permettront de proposer l'approche la plus adaptée en fonction de la question posée (médicale ou scientifique).
NIM-I : Neuroimagerie niveau "initiation" (S2M1)
Il s'agit d'une UE optionnelle du master de neurosciences proposée en S2M1, pouvant aussi être prise comme UE optionnelle pour d’autres masters ou UE libre. L'UE neuroimagerie de niveau "initiation" (NIM-I) correspond à un temps d'enseignement de ~37h et compte pour 3 ECTS. Elle est organisée autour de 3 packages d'enseignement en e-learning (précédé de @) et des travaux à domicile (◊) suivis d'un examen d'évaluation sur internet (⊕) encadrés par des cours magistraux (CM), des TD et des TP dispensés en présentiels (»). Les cours et des questionnaires sont accessibles ici pour ceux qui disposent d'un login.
» Kick-off meeting (1h45)
@ Package 1 : Neuroimagerie anatomique, espaces normalisés, atlas, morphométrie (~6h30)
- Introduction
- Principes de l'IRM
- IRM anatomique
- Espaces normalisés et atlas
- Morphométrie, principes de l'analyse basée sur le voxel
» ⊕1 & TD - Réponse aux questions et visite du plateau technique (1h45)
» TD - Etude morphométrique chez le la souris transgénique (1h45)
@ Package 2 : Anatomie cérébrale fonctionnelle (~5h30)
- Bases d'anatomie cérébrale humaine
- Relation structure-fonction chez l’homme
- Ontogénèse humaine
- Bases d'anatomie cérébrale et relation structure-fonction chez le rongeur
» ⊕2 & TP en e-training (@) - neuro-navigation anatomique et fonctionnelle chez l’homme (1h45)
» CM : Introduction à la neuroimagerie fonctionnelle (1h45)
@ Package 3 : Neuroimagerie fonctionnelle BOLD et rCBF (~6h30)
- Paradigmes expérimentaux
- Métabolisme, régulation, circulation, physiologie du couplage vasculaire
- IRMf BOLD : La réponse BOLD, acquisition, artefacts
- IRMf BOLD : Prétraitement
- IRMf BOLD : Base de l’analyse statistique, initiation à la connectivité
- IRMf ASL-rCBF : acquisition, prétraitement, traitement
- Round tour
» ⊕3 & TD - Réponse aux questions (1h45)
» TD - IRM fonctionnelle appliquée à l’étude des démences (1h45)
◊ Etude d’article à domicile & ⊕4 (~1h30)
» TD d’analyse d’article 1 (1h45)
» Examen d'évaluation finale (~2h30)
Il existe de nombreux documents complémentaires vidéos, e-learning, articles, chapitres, annales etc... accessibles sur une page dédiée à ceux qui disposent d'un login.
NIM-I : Modalités de validation
Les modalités de validation de l'UE NIM-I comprennent :
- La participation à l'enseignement présentiel (TD) compte pour 10% de la note (en règle mardi ou jeudi matin de 8 à 9h45).
- Chaque package se clôture par un quiz en ligne qui ne compte pas pour la note, mais qui permet de s'entrainer pour les examens en ligne plus contraint et comptant pour 25% de la note (EC).
- Un examen final comprenant lui-même :
- 4 questions rédactionnelles courtes en 20 min comptent pour 25% de la note (QRC)
- Une lecture critique d’article sur 1h45 compte pour 40% de la note.
Concernant l'examen final, il existe des annales permettant de vous entrainer (cf. annales).
Contact et inscriptions
Merci de vous inscrire directement auprès des responsables du master. Nous vous engageons à vous rendre au kick-off meeting pour que les informations pratiques puissent vous être communiquées.
Pour toute communication urgente, contactez jack.foucher@ en précisant [NIM] dans le titre. unistra.fr